本发明涉及分子生物学领域,尤其涉及一种抑制dcbld1基因表达的方法及sirna序列。
背景技术:
1、癌症是全球主要的公共卫生问题,根据globocan 2020的预估,肺癌是第二常见的癌症,也是导致癌症死亡的主要原因。肺癌的发病率和死亡率在世界各地差别很大,这反映了不同的吸烟模式、接触环境风险因素和遗传因素。
2、目前,有很多流行病学研究和生物学实验的结果表明肺癌的发生发展是涉及环境暴露和遗传等多因素、多步骤的复杂过程。一般认为环境因素在肺癌发生中起到驱动的作用,而遗传因素决定肺癌的易感性。
3、针对环境因素的预防措施包括戒烟,促进无烟环境,实施烟草控制政策,应对职业危害和降低空气污染水平。针对遗传因素,自2008年以来,gwas研究已经发现了45个肺癌易感区域。短期内,基于肺癌易感位点计算遗传危险分值筛选高危人群进行定期体检,使其在肺癌早期阶段就能够及时有效的治疗。长期而言,基于基因多态性位点的功能及其机制寻找新的预防靶点有重要的临床意义。
4、发明人前期参与了一项东亚非吸烟女性肺癌的gwas研究,通过连锁不平衡,基于snp注释,最终发现rs17079281与肺癌发病危险有关,进一步研究证实rs17079281的t等位基因与转录因子yy结合下调dcbld1,dcbld1的表达与肺癌发病风险相关。既往研究认为除肺癌外,dcbld1还与头颈部鳞状癌发病风险相关,还可作为胃癌和胰腺癌的新型预后标志物。
5、rna干扰(rnai)通过靶向先前被认为不可成药的特定致病基因来控制疾病,与其他疗法如小分子及抗体相比,rnai疗法具有广泛的可成药靶点,其特异性高,能实现精准及个性化疗法,安全性高效果持久,开发成功率更快更高且制造成本相对较低。通过rnai抑制dcbld1的表达有望预防肺癌发生发展。
技术实现思路
1、本发明旨在提供一种抑制dcbld1基因表达的方法,以克服现有技术中存在的不足。
2、为解决上述技术问题,本发明的技术方案是:
3、一种抑制dcbld1基因表达的方法,包括以下步骤:
4、s1设计dcbld1的sirna:
5、根据数据库中dcbld1已知序列设计sirna,针对编码区不同的sirna靶点位置设计了以下四条序列,
6、sidcbld1-1序列、sidcbld1-2序列、sidcbld1-3序列、sidcbld1-4;
7、s2将s1中获得的dcbld1 sirna进行瞬时转染;
8、s 3采用real-time pcr法筛选dcbld1 sirna有效序列,其中sidcbld1-1序列、sidcbld1-2序列为有效序列。
9、在本发明的一个较佳实施例中,进一步包括,
10、所述sidcbld1-1序列:
11、正义链:5’-cagcgaccauccagauuua-3’
12、反义链:5’-uaaaucuggauggucgcug-3’
13、所述sidcbld1-2序列:
14、正义链:5’-gguccauacuguggaagua-3’
15、反义链:5’-uacuuccacaguauggacc-3’
16、所述sidcbld1-3序列:
17、正义链:5’-gcaccaguguuucaacuaa-3’
18、反义链:5’-uuaguugaaacacuggugc-3’
19、sidcbld1-4序列:
20、所述正义链:5’-ggcacaaugacaucuaaga-3’
21、反义链:5’-ucuuagaugucauugugcc-3’。
22、在本发明的一个较佳实施例中,进一步包括,所述dcbld1 sirna的序列的3'端垂悬有dtdt。
23、在本发明的一个较佳实施例中,进一步包括,s1中数据库所述dcbld1已知序列:
24、gene id:285761,nm_001366458.2,nm_001366459.2,nm_001366460.2,nm_173674.3。
25、一种抑制dcbld1基因表达的sirna,所述sirna的序列为:
26、sidcbld1-1序列:
27、正义链:5’-cagcgaccauccagauuua-3’
28、反义链:5’-uaaaucuggauggucgcug-3’;
29、sidcbld1-2序列:
30、正义链:5’-gguccauacuguggaagua-3’
31、反义链:5’-uacuuccacaguauggacc-3’。
32、在本发明的一个较佳实施例中,进一步包括,所述sirna的序列的3'端垂悬有dtdt。
33、本发明的有益效果:
34、通过实验验证,本发明提供了两个效果很好的dcbld1 sirna分子,本发明dcbld1sirna能高效抑制dcbld1基因的表达,mrna水平显著下调,可达70%以上,蛋白表达得到明显抑制且有显著的抑制肿瘤的功能。
1.一种抑制dcbld1基因表达的方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的抑制dcbld1基因表达的方法,其特征在于,
3.根据权利要求1所述的抑制dcbld1基因表达的方法,其特征在于,所述dcbld1 sirna的序列的3'端垂悬有dtdt。
4.根据权利要求1所述的抑制dcbld1基因表达的方法,其特征在于,s1中数据库所述dcbld1已知序列:
5.一种抑制dcbld1基因表达的sirna,其特征在于,所述sirna的序列为:
6.根据权利要求5所述的抑制dcbld1基因表达的sirna,其特征在于,所述sirna的序列的3'端垂悬有dtdt。
