本发明属于生物,具体涉及利用猪全基因组crispr/cas9敲除文库技术,高通量筛选并鉴定到参与猪传染性胃肠炎病毒感染的靶点lpp及其应用。
背景技术:
1、动物疾病不仅危害畜牧产业,同样危害着人类健康。如sars、禽流感和乙型脑炎等人畜共患病,对动物和人类都是一种极大的威胁。如何控制病原微生物感染与传播是近年来一直被关注的热点问题。
2、对于已经有预防性疫苗的传染病,给易感猪群接种疫苗是最为保险的方法。但有些病毒变异快,疫苗防控困难。从遗传上提高畜禽本身的抗病能力从而改善畜禽的健康和畜产品的安全,是当前亟须解决的重大问题,也是国家重视的畜禽种业技术难题。
3、目前利用基因编辑抗病育种手段改造宿主基因,从而提高宿主的抗病能力,实现阻止病毒感染已有成功的案例报道。如基因编辑抗蓝耳病猪和抗结核病转基因牛。但这种方法的关键之处在于发现病原微生物感染必需的关键宿主基因。因此,如何在动物细胞中实现高通量筛选与病原微生物互作的宿主关键基因是亟需解决的核心技术问题。
4、猪肠道冠状病毒是目前危害养猪产业的重要病原。目前已发现能够感染猪肠道的致病性冠状病毒有4种:猪传染性胃肠炎病毒、猪流行性腹泻病毒、猪丁型冠状病毒和猪肠道甲型冠状病毒。其中,猪传染性胃肠炎是由传染性胃肠炎病毒(tgev)感染引起的一种以严重腹泻、呕吐和脱水为临床特征的高度接触性猪传染病。不同日龄的猪均可感染,新牛仔猪死亡率较高(通常100%)。目前该种疾病还没有特效治疗药物,发病后要及时采取措施,需将患病猪扑杀进行无害化处理。
5、尽管tgev疫苗是预防流行性猪传染性胃肠炎的有效措施,但由于tgev感染机制尚不清楚,目前尚无有效的治疗药物,尤其缺乏有效宿主靶向的分子靶点。因此,本领域迫切需要开发新的能实现用于治疗tgev感染致病、提高动物尤其是猪tgev抗病力的靶点。
技术实现思路
1、本发明的一个目的是提供一种基于猪全基因组crispr/cas9敲除文库技术筛选并鉴定出参与tgev感染的关键宿主因子lpp,lpp基因可作为靶点用于制备抗猪传染性胃肠炎病毒tgev感染药物,还可以制备抗猪传染性胃肠炎病毒感染的基因编辑细胞和动物模型。
2、与现有技术相比,本发明具有如下有益效果:
3、本发明首次提供了一类参与tgev感染的靶点和基因编辑细胞系,所提供的靶点为防治tgev感染提供药物靶点,还为畜禽的抗病育种研究提供材料;本发明提供关键候选靶点lpp敲除细胞株,并表明lpp基因敲除后可抑制tgev感染。
1.lpp基因抑制剂在制备抗猪传染性胃肠炎病毒tgev感染药物中的应用,其特征在于,所述的抑制剂为靶向lpp基因的cas蛋白和特异性sgrna。
2.靶向lpp基因的特异性sgrna在采用crispr/cas技术制备抗猪传染性胃肠炎病毒感染的基因编辑细胞和动物模型中的应用。
3.用于防治猪传染性胃肠炎病毒tgev感染的药物,其特征在于,所述的药物为靶向lpp基因的cas蛋白和特异性sgrna。
4.根据权利要求3所述的药物,其特征在于,所述sgrna的序列如 seq id no.2所示。