用于鉴定火烈鸟性别的RAA-PfAgo组合物、试剂盒及应用的制作方法

    技术2025-02-01  61


    本发明涉及生物检测,特别是涉及用于鉴定火烈鸟性别的raa-pfago组合物、试剂盒及应用。


    背景技术:

    1、火烈鸟(phoenicopteridae)属于红鹳科鸟类,多分布于美洲、欧洲等地。火烈鸟属于单态性鸟,即人们无法单一从外观判断其性别,在动物园中,若能快速准确地判断出火烈鸟的性别,有利于饲养人员提前做好饲养管理、繁殖育种与疫病防治规划。鸟类传统的性别鉴定方法有翻肛法和内窥镜法,但这两种方法对鸟类伤害较大,不适用于火烈鸟等珍稀鸟类。目前,pcr等分子鉴定技术已为火烈鸟性别鉴定提供了工具,但是pcr方法设备要求较高,耗时长,不便于野外现场操作,该方法难以普及于一般动物园或饲养场。


    技术实现思路

    1、针对上述问题,本发明提供了一种用于鉴定火烈鸟性别的raa-pfago组合物,利用该raa-pfago组合物能够对雌性火烈鸟检测到扩增信号,而雄性火烈鸟无扩增信号,进而对火烈鸟的性别进行判别,以此raa-pfago组合物为基础对火烈鸟进行性别鉴定,整个反应不需要复杂的仪器,效率高、特异性好、灵敏度高、检测时间短、无创检测,更适用于现场检测。

    2、本发明提供了一种用于鉴定火烈鸟性别的raa-pfago组合物,包括raa引物对、guide dna、探针;所述raa引物对如seq id no.9、seq id no.10所示,所述guide dna如seqid no.11所示,所述探针的序列如seq id no.17所示。

    3、重组酶介导等温核酸扩增技术(recombinase-aided amplification,raa)是一种恒温扩增技术,其反应过程包括重组酶结合、链置换和延伸三个阶段,在37~42℃条件下,反应20~30min即可完成指数增长达到检测水平,适用于基因快速扩增。pfago蛋白是一类存在于原核生物体内的蛋白,其在5’磷酸化guide dna引导下可靶向切割单链或双链dna,现多用于分子检测。raa-pfago系统多用于病毒、细菌和寄生虫等检测,但尚未见用于火烈鸟性别鉴定的报道。基于此,本发明人根据雌性火烈鸟w染色体和雄性z染色体的chd基因序列差异,提出上述raa-pfago组合物,利用该raa-pfago组合物能够对雌性火烈鸟检测到扩增信号,而雄性火烈鸟无扩增信号,进而对火烈鸟的性别进行判别,将上述raa-pfago组合物结合raa-pfago技术建立的快速准确、便捷无创的火烈鸟性别鉴别方法,不需要复杂的仪器,效率高、特异性好、灵敏度高、检测时间短、无创检测,更适用于现场检测。

    4、本发明还提供了一种用于鉴定火烈鸟性别的检测体系,包括raa扩增反应体系、pfago检测反应体系,所述raa扩增反应体系包括权利要求1所述的raa引物对,所述pfago检测反应体系包括所述guide dna、探针。

    5、在其中一个实施例中,所述pfago检测反应体系还包括pfago蛋白。

    6、在其中一个实施例中,所述探针的5’端连接荧光基团,所述探针的3’端连接淬灭基团。

    7、在其中一个实施例中,所述guide dna的5’端连接磷酸基团。

    8、在其中一个实施例中,所述raa扩增反应体系的反应条件包括:孵育温度为37-42℃,孵育时间为20-30min;所述pfago检测反应体系的反应条件包括:反应温度为95-98℃,反应时间为20-30min。

    9、在其中一个实施例中,所述raa引物对的工作浓度为0.3-0.5μm。

    10、所述工作浓度为上述raa引物对在使用时能够达到预期效果的浓度,可以理解的,本领域技术人员在配制含有上述raa引物对的试剂时,可以配制浓度更高的母液或者储备液,待使用时再稀释,所述母液或者储备液及其浓度均在本发明的保护范围之内。

    11、本发明还提供了一种用于鉴定火烈鸟性别的试剂盒,包括所述raa-pfago组合物,或包括所述检测体系。

    12、在其中一个实施例中,所述试剂盒还包括阴性对照品。

    13、本发明还提供了一种火烈鸟性别鉴定的方法,包括以下步骤:提取待测样本的核酸,采用所述试剂盒进行检测。

    14、上述方法最低检测限是0.6ng,全程在1个小时内可以快速方便无创鉴定出火烈鸟的性别,整个反应不需要复杂的仪器。上述火烈鸟性别鉴定的方法,具有效率高、特异性好、灵敏度高、检测时间短、无创,更适用于现场检测的优点。

    15、在其中一个实施例中,所述待测样本包括羽毛。

    16、本发明还提供了所述raa-pfago组合物或所述的检测体系在制备用于鉴定火烈鸟性别产品中的应用。

    17、与现有技术相比,本发明具有以下有益效果:

    18、本发明的一种用于鉴定火烈鸟性别的raa-pfago组合物,利用该raa-pfago组合物能够对雌性火烈鸟检测到扩增信号,而雄性火烈鸟无扩增信号,进而对火烈鸟的性别进行判别。以此raa-pfago组合物为基础对火烈鸟进行性别鉴定的方法,整个反应不需要复杂的仪器,效率高、特异性好、灵敏度高、检测时间短、无创检测,更适用于现场检测。



    技术特征:

    1.一种用于鉴定火烈鸟性别的raa-pfago组合物,其特征在于,包括raa引物对、guidedna、探针;所述raa引物对如seq id no.9、seq id no.10所示,所述guide dna如seq idno.13所示,所述探针的序列如seq id no.19所示。

    2.一种用于鉴定火烈鸟性别的检测体系,其特征在于,包括raa扩增反应体系、pfago检测反应体系,所述raa扩增反应体系包括权利要求1所述的raa引物对,所述pfago检测反应体系包括权利要求1所述的guide dna、探针。

    3.根据权利要求2所述的检测体系,其特征在于,所述pfago检测反应体系还包括pfago蛋白。

    4.根据权利要求3所述的检测体系,其特征在于,所述探针的5’端连接荧光基团,所述探针的3’端连接淬灭基团。

    5.根据权利要求2-4中任一项所述的检测体系,其特征在于,所述guide dna的5’端连接磷酸基团。

    6.根据权利要求5所述的检测体系,其特征在于,所述raa扩增反应体系的反应条件包括:孵育温度为37-42℃,孵育时间为20-30min;所述pfago检测反应体系的反应条件包括:反应温度为95-98℃,反应时间为20-30min。

    7.一种用于鉴定火烈鸟性别的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1所述的raa-pfago组合物,或包括权利要求2-6中任一项所述的检测体系。

    8.一种火烈鸟性别鉴定的方法,其特征在于,包括以下步骤:提取待测样本的核酸,采用权利要求7所述试剂盒进行检测。

    9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述待测样本包括羽毛。

    10.权利要求1所述raa-pfago组合物或权利要求2-6中任一项所述的检测体系在制备用于鉴定火烈鸟性别产品中的应用。


    技术总结
    本发明涉及一种用于鉴定火烈鸟性别的RAA‑PfAgo组合物、试剂盒及应用,涉及生物检测技术领域。RAA‑PfAgo组合物包括RAA引物对、guide DNA、探针;RAA引物对如SEQ ID NO.9、SEQ ID NO.10所示,所述guide DNA如SEQ ID NO.13所示,所述探针的序列如SEQ ID NO.19所示。利用该RAA‑PfAgo组合物能够对雌性火烈鸟检测到扩增信号,而雄性火烈鸟无扩增信号,进而对火烈鸟的性别进行判别,以此RAA‑PfAgo组合物为基础对火烈鸟进行性别鉴定,整个反应不需要复杂的仪器,效率高、特异性好、灵敏度高、检测时间短、无创检测,更适用于现场检测。

    技术研发人员:曾繁文,张守全,谭深滦,陈绚姣,陈谭子芃,吴其锐
    受保护的技术使用者:广州动物园
    技术研发日:
    技术公布日:2024/10/24
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