熔解温度修正方法、装置、计算设备及机器可读存储介质与流程

    技术2024-12-29  42


    本发明涉及生物检测领域,具体地涉及一种熔解温度修正方法、装置、计算设备及机器可读存储介质。


    背景技术:

    1、pcr(polymerase chain reaction,聚合酶链式反应)熔解反应是一种用于分析dna(deoxyribonucleic acid)双链分离特性的技术,通常用于检测pcr产物中的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,snp)或确定dna片段的熔解温度(meltingtemperature,tm)。pcr熔解反应是pcr技术的一个重要补充,提供了关于pcr产物特性的额外信息,对于遗传研究、分子诊断和其他生物学研究具有广泛应用价值。

    2、通常在pcr扩增后,温度会逐步升高,达到一个特定的温度范围,以观察pcr产物的吸光度或荧光强度随温度的变化。dna双链在高温下会解开成单链,导致吸光度或荧光强度的变化。pcr修正后熔解曲线显示了吸光度或荧光信号随温度的变化情况,孔位的pcr修正后熔解曲线上会出现的峰值对应着pcr产物的熔解温度。然而,通常得到的修正后熔解曲线都存在着峰值偏移的现象,进而导致了确定的熔解温度不准确。


    技术实现思路

    1、本发明实施例的目的是提供一种熔解温度修正方法、装置、计算设备及机器可读存储介质,熔解温度修正方法用于解决确定的熔解温度不准确的问题。

    2、为了实现上述目的,第一方面,本申请提供一种熔解温度修正方法,熔解温度修正方法包括:

    3、获取熔解实验时孔位的温度修正参数;

    4、利用温度修正参数对孔位的熔解数据进行修正,以将每个反应温度点更新为修正温度点,其中,熔解数据包括熔解实验时孔位的多个反应温度点,以及每个反应温度点对应的荧光值;

    5、根据所有的修正温度点以及每个修正温度点对应的荧光值,构建孔位的修正后熔解曲线;

    6、基于修正后熔解曲线,确定孔位的熔解温度。

    7、本申请的实施例中,获取熔解实验时孔位的温度修正参数,包括:

    8、从预设温度区间中确定至少两个目标温度;

    9、针对任意一个目标温度,获取目标温度对应的孔位的实际温度;

    10、基于所有的目标温度与对应的实际温度,得到熔解实验时孔位的温度修正参数。

    11、本申请的实施例中,基于所有的目标温度与所有的实际温度,得到熔解实验时孔位的温度修正参数,包括:

    12、分别计算每个目标温度与对应的实际温度之间的温度偏差;

    13、对所有的目标温度和对应的温度偏差进行线性拟合,得到熔解实验时孔位的温度修正参数。

    14、本申请的实施例中,预设温度区间的上限值大于熔解反应的终止温度,预设温度区间的下限值小于熔解反应的起始温度。

    15、本申请的实施例中,基于修正后熔解曲线,确定孔位的熔解温度,包括:

    16、对修正后熔解曲线进行曲线平滑处理,得到平滑化的修正后熔解曲线;

    17、基于平滑化的修正后熔解曲线,确定孔位的熔解温度。

    18、本申请的实施例中,熔解温度修正方法还包括:

    19、获取熔解实验时孔位的实时温度;

    20、在实时温度等于反应温度点的情况下,获取反应温度点对应的荧光值,以得到孔位的熔解数据,其中,相邻的两个反应温度点之间的温度间隔为预设温度间隔。

    21、本申请的实施例中,根据所有的修正温度点以及每个修正温度点对应的荧光值,构建孔位的修正后熔解曲线,包括:

    22、将修正温度点作为横坐标,并将修正温度点对应的荧光值作为纵坐标,构建孔位的关系曲线;

    23、对关系曲线的温度进行求导处理,得到孔位的修正后熔解曲线。

    24、第二方面,本申请提供一种熔解温度修正装置,熔解温度修正装置包括:

    25、修正参数获取模块,用于获取熔解实验时孔位的温度修正参数;

    26、熔解数据修正模块,用于利用温度修正参数对孔位的熔解数据进行修正,以将每个反应温度点更新为修正温度点,其中,熔解数据包括熔解实验时孔位的多个反应温度点,以及每个反应温度点对应的荧光值;

    27、熔解曲线构建模块,用于根据所有的修正温度点以及每个修正温度点对应的荧光值,构建孔位的修正后熔解曲线;

    28、熔解温度确定模块,用于基于修正后熔解曲线,确定孔位的熔解温度。

    29、第三方面,本申请提供一种计算设备,包括:

    30、存储器,被配置成存储指令;以及

    31、处理器,被配置成从存储器调用指令以及在执行指令时能够实现上述的熔解温度修正方法。

    32、第四方面,本申请提供一种机器可读存储介质,机器可读存储介质上存储有指令,指令用于使得机器执行上述的熔解温度修正方法。

    33、本申请提供一种熔解温度修正方法,熔解温度修正方法包括:获取熔解实验时孔位的温度修正参数;利用温度修正参数对孔位的熔解数据进行修正,以将每个反应温度点更新为修正温度点;根据所有的修正温度点以及每个修正温度点对应的荧光值,构建孔位的修正后熔解曲线;基于修正后熔解曲线,确定孔位的熔解温度。利用温度修正参数对熔解实验时孔位的温度进行修正,以得到温度修正后的修正后熔解曲线。构建修正后熔解曲线时考虑了孔位温度差异的影响,避免了峰值偏移现象影响熔解温度的确定,进而提高了确定的熔解温度的准确性。

    34、本发明实施例的其它特征和优点将在随后的具体实施方式部分予以详细说明。



    技术特征:

    1.一种熔解温度修正方法,其特征在于,所述熔解温度修正方法包括:

    2.根据权利要求1所述的熔解温度修正方法,其特征在于,所述获取熔解实验时孔位的温度修正参数,包括:

    3.根据权利要求2所述的熔解温度修正方法,其特征在于,所述基于所有的所述目标温度与所有的所述实际温度,得到熔解实验时孔位的温度修正参数,包括:

    4.根据权利要求2所述的熔解温度修正方法,其特征在于,所述预设温度区间的上限值大于所述熔解反应的终止温度,所述预设温度区间的下限值小于所述熔解反应的起始温度。

    5.根据权利要求1所述的熔解温度修正方法,其特征在于,所述基于所述修正后熔解曲线,确定所述孔位的熔解温度,包括:

    6.根据权利要求1所述的熔解温度修正方法,其特征在于,所述熔解温度修正方法还包括:

    7.根据权利要求1所述的熔解温度修正方法,其特征在于,所述根据所有的所述修正温度点以及每个所述修正温度点对应的荧光值,构建所述孔位的修正后熔解曲线,包括:

    8.一种熔解温度修正装置,其特征在于,所述熔解温度修正装置包括:

    9.一种计算设备,其特征在于,包括:

    10.一种机器可读存储介质,其特征在于,所述机器可读存储介质上存储有指令,所述指令用于使得机器执行根据权利要求1至7中任一项所述的熔解温度修正方法。


    技术总结
    本申请实施例提供一种熔解温度修正方法、装置、计算设备及机器可读存储介质,属于生物检测领域。熔解温度修正方法包括:获取熔解实验时孔位的温度修正参数;利用温度修正参数对孔位的熔解数据进行修正,以将每个反应温度点更新为修正温度点;根据所有的修正温度点以及每个修正温度点对应的荧光值,构建孔位的修正后熔解曲线;基于修正后熔解曲线,确定孔位的熔解温度。利用温度修正参数对熔解实验时孔位的温度进行修正,以得到温度修正后的修正后熔解曲线。构建修正后熔解曲线时考虑了孔位温度差异的影响,避免了峰值偏移现象影响熔解温度的确定,进而提高了确定的熔解温度的准确性。

    技术研发人员:解亚平,张辉,凌建钢,戴立忠
    受保护的技术使用者:湖南元景智造科技有限公司
    技术研发日:
    技术公布日:2024/10/24
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