本发明属于基因检测试剂盒,涉及一种用于指导人抑郁症用药的相关基因检测试剂盒及其应用。
背景技术:
1、抑郁症,也被称为抑郁障碍,是一种高发病、高临床治愈率但低治疗接受率以及高复发率的精神障碍。其主要特征是显著而持久的情绪低落,有的患者可能存在自伤、自杀行为,甚至可能伴有妄想、幻觉等精神病性症状。根据世界卫生组织报告,目前抑郁症是全球第四大疾病负担,也是导致患者功能残疾的主要原因之一,全球抑郁症发病率约为11%,全球约有3.4亿抑郁症患者,大约有1/7的人会在不同时期遭受抑郁症困扰。目前控制抑郁症的主要手段是药物治疗,但是药物治疗存在明显的个体差异,主要表现为无明显疗效或者疗效不稳定,甚至引发一系列的不良反应,如肝功能受损、粒细胞减少、锥体外系反应(eps)、代谢内分泌失调等等。临床数据表明,在抑郁症的治疗中,仅有不到45%的患者在足量足疗程的抗抑郁药物治疗下临床症状能完全缓解,而导致这些疗效差异和不良反应的主要原因可能与体内代谢酶、受体或者转运体的突变有关。
2、因此,利用基因检测手段,明确个体的相关药物代谢酶的基因多态性,依据个体基因特性指导用药和给出相应的治疗方案,最终实现由“对症下药”到“对人下药”即个体化用药的转变,这对提高药效和减少药物不良反应事件发生具有极其重要的作用,且具有一定的社会意义和经济意义。
技术实现思路
1、本发明提供一种人抑郁症相关基因检测的引物组,实现了dna分型同时检测43个多态性位点的人抑郁症相关基因检测。
2、本发明还提供一种用于指导人抑郁症用药的相关基因检测试剂盒,该试剂盒采用多重荧光pcr-毛细管电泳平台,结合突变阻滞扩增技术(arms),对抑郁症类药物相关snp基因位点的人体外定性检测,解决现有检测方法中成本较高、操作难度较大等问题。
3、本发明解决其技术问题所采用的技术方案是:
4、一种人抑郁症相关基因检测的引物组,该引物组包括用于扩增abcb1、adra2a、cyp1a2、cyp2b6、cyp2c19、cyp2d6、cyp3a4、dbh、fkbp5、gnb3、htr1a、htr2a、mc1r、mdga2、ncam1、nrxn1、rabep1、sacm1l、slc6a4、spr19基因的43个位点的两条长度不一的上游引物和一条通用的荧光下游引物,如seq id no.1~127所示的核苷酸序列(具体见表1);或与这些序列具有至少95%同一性的同功能序列。
5、一种含有本发明所述的引物组的用于指导人抑郁症用药的相关基因检测试剂盒。
6、作为优选,所述试剂盒的pcr扩增的反应体系还包括dna聚合酶,dntps,pcr反应缓冲液和mg2+。
7、作为优选,所述试剂盒的pcr扩增的反应体系如下:10×pcrbuffer 1μl,mg2+1.8~2.2μm(终浓度),dntp 500μm(终浓度),扩增引物混合液1μl(终浓度0.1μm,各引物之间量比为1),taq酶1u,水补齐至10μl。更优选的是,所述试剂盒的pcr扩增的反应体系如下:10×pcrbuffer 1μl,mg2+2μm(终浓度),dntp 500μm(终浓度),扩增引物混合液1μl(终浓度0.1μm,各引物之间量比为1),taq酶1u,水补齐至10μl。
8、作为优选,所述试剂盒还包括用于毛细管电泳测序的反应体系,该反应体系采用pcr扩增产物配置,10μl体积的反应体系含有:甲酰胺8.85μl,orange500内标0.15μl,pcr扩增产物1μl。
9、作为优选,所述试剂盒还包括:阴性质控品,阳性质控品。
10、作为优选,如seq id no.1~52所示的核苷酸序列的扩增引物在反应体系中的摩尔浓度为0.1~1.0μm,如seq id no.53~127所示的核苷酸序列的扩增引物在反应体系中的摩尔浓度为0.1~1.0μm。
11、作为优选,所述试剂盒中的pcr反应液由pcr反应液a、pcr反应液b1和pcr反应液b2组成,其中pcr反应液a含有10×pcr buffer、mg2+2μm、dntp 500μm、taq酶1u,pcr反应液b1含有终浓度0.1μm的seq id no.1~52引物混合液,各引物之间量比为1,pcr反应液b2含有终浓度0.1μm的seq id no.53~127引物混合液,各引物之间量比为1。
12、一种本发明所述人抑郁症相关基因检测的引物组或所述的用于指导人抑郁症用药的相关基因检测试剂盒在非诊断或治疗目的的指导人抑郁症疾病用药产品中的应用。
13、一种以非诊断或治疗目的检测人抑郁症相关基因多态性位点的方法,该方法包括如下步骤:
14、s1、样本采集及核酸提取;
15、s2、采用所述人抑郁症相关基因检测的引物组对待测样本进行pcr扩增,得到,pcr扩增产物;
16、s3、用上一步得到的pcr扩增产物配置毛细管电泳测序反应体系;
17、s4、检测结果分析及判读:
18、对样本进行检测时,当样本位点分子片段长度只与野生型质控分子片段长度相差0.6内时,判断该位点为野生型,当样本位点分子片段长度只与突变型质控分子片段长度相差0.6内时,判断该位点为突变型,当样本位点出现双峰,既有片段长度与野生型质控分子片段长度相差0.6内的片段,又有与突变型质控分子片段长度相差0.6内的片段时,判断该位点为杂合型。
19、本发明提供的检测方法,采用多重等位基因特异性pcr技术对目的位点进行扩增,通过毛细管电泳进行扩增产物的检测,完成对目的位点分型的检测。根据每个检测位点的分型设计两条长度不一的特异性上游引物和一条荧光标记的下游引物。每条特异性引物只能与对应基因型的dna模板结合并进行扩增。完成pcr扩增和毛细管电泳检测后,通过特定荧光标记、特定长度的扩增产物的有无即可判定样本特定位点是否存在特定基因型。通过以上覆盖抗抑郁症疾病方面用药代谢靶点基因,达到对阿戈美拉汀、艾司西酞普兰、安非他酮、地昔帕明、度洛西汀、伏硫西汀、氟伏沙明、氟西汀、吗氯贝胺、米安色林、米氮平、米那普仑、帕罗西汀、曲唑酮、去甲替林、去甲文拉法辛、三环类(丙咪嗪/多塞平/曲米帕明/氯米帕明/阿米替林)、舍曲林、文拉法辛、西酞普兰等20种药物的abcb1、adra2a、cyp1a2、cyp2b6、cyp2c19、cyp2d6、cyp3a4、dbh、fkbp5、gnb3、htr1a、htr2a、mc1r、mdga2、ncam1、nrxn1、rabep1、sacm1l、slc6a4、spr19基因的43个位点进行检测,检测方法准确稳定,检测节约时间与经济成本。并且一次实验反应能更好地检测更多的位点,检测通量高,单孔实现43重杂合突变位点检测。
20、本发明实现了dna分型同时检测43个多态性位点,检测位点多,灵敏度高,特异性强,结果容易判读的技术效果,可以为临床提供快捷、高效和易解读的抗抑郁症的用药指导,解决了目前临床上缺乏适当的针对抑郁症进行基因检测及用药指导的产品的问题。本发明利用基因检测手段,明确个体的相关药物代谢酶的基因多态性,依据个体基因特性指导用药和给出相应的治疗方案,最终实现由“对症下药”到“对人下药”即个体化用药的转变,对提高药效和减少药物不良反应事件发生具有极其重要的作用。
1.一种人抑郁症相关基因检测的引物组,其特征在于:该引物组包括用于扩增abcb1、adra2a、cyp1a2、cyp2b6、cyp2c19、cyp2d6、cyp3a4、dbh、fkbp5、gnb3、htr1a、htr2a、mc1r、mdga2、ncam1、nrxn1、rabep1、sacm1l、slc6a4、spr19基因的43个位点的两条长度不一的上游引物和一条通用的荧光下游引物,如seq id no.1~127所示的核苷酸序列:
2.一种含有权利要求1所述的引物组的用于指导人抑郁症用药的相关基因检测试剂盒。
3.根据权利要求2所述的用于指导人抑郁症用药的相关基因检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒的pcr扩增的反应体系还包括dna聚合酶,dntps,pcr反应缓冲液和mg2+。
4.根据权利要求2所述的用于指导人抑郁症用药的相关基因检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒的pcr扩增的反应体系如下:
5.根据权利要求2所述的用于指导人抑郁症用药的相关基因检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括:阴性质控品,阳性质控品。
6.根据权利要求2所述的用于指导人抑郁症用药的相关基因检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括用于毛细管电泳测序的反应体系,该反应体系采用pcr扩增产物配置,10μl体积的反应体系含有:甲酰胺8.85μl,orange500内标0.15μl,pcr扩增产物1μl。
7.根据权利要求2所述的用于指导人抑郁症用药的相关基因检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒中的pcr反应液由pcr反应液a、pcr反应液b1和pcr反应液b2组成,其中pcr反应液a含有10×pcr buffer、mg2+2μm、dntp 500μm、taq酶1u,pcr反应液b1含有终浓度0.1μm的seq id no.1~52引物混合液,各引物之间量比为1,pcr反应液b2含有终浓度0.1μm的seqid no.53~127引物混合液,各引物之间量比为1。
8.根据权利要求2所述的用于指导人抑郁症用药的相关基因检测试剂盒,其特征在于:如seq id no.1~52所示的核苷酸序列的扩增引物在反应体系中的摩尔浓度为0.1~1.0μm,如seq id no.53~127所示的核苷酸序列的扩增引物在反应体系中的摩尔浓度为0.1~1.0μm。
9.一种权利要求1所述人抑郁症相关基因检测的引物组或权利要求2所述的用于指导人抑郁症用药的相关基因检测试剂盒在非诊断或治疗目的的指导人抑郁症疾病用药产品中的应用。
10.一种以非诊断或治疗目的检测人抑郁症相关基因多态性位点的方法,其特征在于该方法包括如下步骤: