本发明属于微生物代谢工程,具体涉及一种用于合成lnfpⅰ的α-1,2-岩藻糖基转移酶、重组工程菌株及其构建方法和应用。
背景技术:
1、母乳是供婴儿关键生长发育阶段所需的必要营养物质,如可提供能量、免疫调节、改善肠道菌群分布及促进大脑发育的作用。母乳寡糖(human milk oligosaccharides,hmos)是一种存在于母乳中的可充当益生元的营养物质。hmos作为继乳糖和脂质后的第三大固体成分,在初乳中含量可达20g/l以上,并且其在促进新生儿的健康和生长发育方面具有独特的生理功能。乳糖-n-岩藻黄素五糖i(lnfpⅰ)是人类母乳中仅次于2′-fl的丰度第二高的岩藻糖基化hmo。lnfpⅰ属于岩藻糖基化的中性母乳寡糖,在母乳中的含量约为0.8-5g/l,分子式是c32h55no25,分子质量为853.77。
2、lnfpⅰ被发现具有多种功能活性,如调节肠道菌群、抵抗病原体粘附、免疫调节、促进神经系统发育和修复、降低血清胆固醇水平、减少肥胖、抑制肠道细菌生长和抑制体内炎症反应,并且表现出高安全性。
3、目前,lnfpⅰ可以通过母乳提取、化学合成、一锅多酶法获得。然而,这三种方法都存在明显的局限性,无法大批量获取与合成,这极大限制lnfp i的市场化应用。相比之下,微生物发酵法已经被广泛应用于从头合成hmos;通过定向改造工程菌株的内源代谢,使其能利用廉价易获取的原料实现lnfp i的高效绿色合成,兼具安全、环保、可持续的发展的特点。
4、在实施lnfp i的从头合成细胞工厂构建过程中,α-1,2-岩藻糖基转移酶是关键限速酶,其催化活性决定了lnfp i合成的最终滴度。然而目前已报道的可用于生物合成lnfpi的α-1,2-岩藻糖基转移酶数量较少,催化活力有限。因此,亟需筛选新型的α-1,2-岩藻糖基转移酶以增加lnfp i合成过程中的可用酶及高效酶。
技术实现思路
1、针对上述问题,本发明的目的在于提供一种用于合成lnfpⅰ的α-1,2-岩藻糖基转移酶、重组工程菌株及其构建方法和应用,解决目前合成lnfp i可用生物合成的α-1,2-岩藻糖基转移酶数量较少、生产滴度不高的问题。
2、为了解决上述技术问题,本发明采用的技术方案为:
3、本发明从微生物中筛选出了一种来源于alphaproteobacteria的α-1,2-岩藻糖基转移酶(ncbi号为wp_037157133.1),命名为ry2ft。所述α-1,2-岩藻糖基转移酶ry2ft用于合成lnfpⅰ,所述α-1,2-岩藻糖基转移酶ry2ft的氨基酸序列如seq id no.1所示。
4、基于上述,本发明提供一种含有上述α-1,2-岩藻糖基转移酶的重组工程菌。
5、本发明还提供一种重组工程菌的构建方法,将重组质粒pcdf-wbgo、prsf-cbgw、pet-ry转入菌株e06,得到所需重组工程菌e06-1;
6、所述pet-ry含有如权利要求1所述α-1,2-岩藻糖基转移酶的编码基因,用于过表达所述α-1,2-岩藻糖基转移酶。其中,pet-ry为petduet-1衍生质粒,整合并过表达新型α-1,2-岩藻糖基转移酶ry2ft的编码基因。
7、进一步的,所述重组质粒pcdf-wbgo通过将wbgo基因克隆到pcdfduet-1中获得;
8、所述prsf-cbgw的构建方法为:
9、使用引物pcdf-galu-f和pcdf-galu-r扩增pcdf-wbgo质粒的载体片段,然后通过吉布森组装法进行片段组装,生成重组质粒pcdf-galu-wbgo;其中,pcdf-galu-wbgo为pcdfduet-wbgo的衍生质粒,整合并过表达galu和wbgo。
10、以重组质粒pcdf-galu-wbgo中galu位置为一号克隆位置,wbgo位置为二号克隆位置;通过将manc-manb基因簇构建于质粒的一号克隆位置,gmd-wcag基因簇构建于二号克隆位置,获得prsf-cbgw;其中,prsf-cbgw为prsfduet-1衍生质粒,整合并过表达manc-manb,gmd-wcag。
11、进一步的,所述galu编码的氨基酸序列如seq id no.2所示;wbgo编码的氨基酸序列如seq id no.3所示;manc-manb编码的氨基酸序列如seq id no.4所示;gmd-wcag编码的氨基酸序列如seq id no.5所示。
12、进一步的,所述菌株e06以大肠杆菌为出发菌株,敲除出发菌株基因组中的udp-葡萄糖脂质载体转移酶编码基因wcaj,β-半乳糖苷酶编码基因lacz,udp-乙酰氨基葡萄糖-2-异构酶编码基因wecb,糖外排蛋白编码基因seta,葡萄糖脱氢酶编码基因gcd;并将菌株基因组中nagb、poxb、arsb位点分别替换成编码β-1,3-n-乙酰葡糖胺转移酶的基因lgta;同时,将udp-葡萄糖-6-脱氢酶编码基因ugd位点替换为大肠杆菌mg1655基因组来源的编码尿苷二磷酸葡萄-4-差向异构酶的基因gale,并在基因组上过表达磷酸氨基葡萄糖变位酶编码基因glmm,获得重组菌株e06。
13、进一步的,所述所述出发菌株为大肠杆菌bl21(de3);
14、所述β-1,3-n-乙酰葡糖胺转移酶的氨基酸序列如seq id no.6所示,所述尿苷二磷酸葡萄-4-差向异构酶的氨基酸序列如seq id no.7所示;所述磷酸氨基葡萄糖变位酶的氨基酸序列如seq id no.8所示。
15、上述重组工程菌及构建方法得到的重组工程菌可在制备lnfpⅰ中进行应用。
16、基于上述,本发明还提供一种生产乳糖-n-岩藻黄素五糖i的方法,以上述构建方法得到的重组工程菌为发酵菌株,加入乳糖和iptg,发酵生产乳糖-n-岩藻黄素五糖i。
17、在一种实施方式中,生产乳糖-n-岩藻黄素五糖i的方法,包括以下步骤:
18、(1)将重组菌接种于种子培养基,培养,获得种子液;
19、(2)将步骤(1)中所获得的种子液接种于发酵培养基,培养至od600为0.6-0.8,向培养体系中加入终浓度为5g/l的乳糖和0.1mm的iptg,于25℃发酵生产lnfp i。
20、进一步的,所述发酵培养基含有甘油,其浓度为30g/l;
21、在一种实施方式中,生产乳糖-n-岩藻黄素五糖i的方法,包括以下步骤:
22、(1)将所述重组菌接种于种子培养基,培养,获得一级种子液;
23、(2)将步骤(1)中所获得的种子液接种于二级种子培养基,培养至od600为2-3,随即将二级种子液接种于5l的发酵罐中,按10%的比例接种,培养至od600为16-20,随后向发酵罐培养体系中加入终浓度为5g/l的乳糖和0.1mm的iptg,于25℃发酵生产lnfp i。
24、进一步的,发酵期间的溶氧为20~50%;优选的,溶氧为30%。
25、进一步的,发酵期间的ph为6~7;可优选的,ph为6.5~6.7。
26、进一步的,发酵期间,通过向发酵体系中流加氨水维持发酵体系ph。
27、进一步的,所述发酵培养基中含有甘油,通过补料维持发酵体系中甘油充足,且通过补料维持发酵体系中含有乳糖。
28、在一种实施方式中,生产乳糖-n-岩藻黄素五糖i的方法,包括以下步骤:
29、(1)将所述重组菌接种于种子培养基,培养,获得一级种子液;
30、(2)将步骤(1)中所获得的种子液接种于二级种子液,培养至od600为2-3,向培养体系中加入终浓度为5g/l乳糖和0.1mmiptg,于25℃发酵生产lnfp i。
31、进一步的,发酵期间的溶氧为20~60%;优选的,溶氧为30%。
32、进一步的,发酵期间的ph为6~7;优选的,ph为6.5~6.7。
33、进一步的,发酵期间通过向发酵体系中流加氨水维持发酵体系ph。
34、进一步的,所述发酵培养基中含有甘油,通过补料维持发酵体系中甘油充足,且通过补料维持发酵体系中含有乳糖。
35、进一步的,发酵期间搅拌速度维持在350rpm。
36、发明的有益效果在于:
37、(1)本发明构建得到的重组菌株e06-1能够实际有效地生产lnfp i,并且在摇瓶发酵、5l发酵罐、百升发酵罐中均能可持续地合成lnfp i。
38、(2)本发明的重组菌株中引入了新筛选出的α-1,2-岩藻糖基转移酶ry2ft,丰富了目前能实现乳糖-n-岩藻黄素五糖i生物合成的酶的数量。
1.一种α-1,2-岩藻糖基转移酶,其特征在于,所述α-1,2-岩藻糖基转移酶用于合成lnfpⅰ,所述α-1,2-岩藻糖基转移酶的氨基酸序列如seq id no.1所示。
2.一种含有如权利要求1所述的α-1,2-岩藻糖基转移酶的重组工程菌。
3.一种重组工程菌的构建方法,其特征在于,将重组质粒pcdf-wbgo、prsf-cbgw、pet-ry转入菌株e06,得到所需重组工程菌e06-1;
4.根据权利要求3所述的重组工程菌的构建方法,其特征在于,所述重组质粒pcdf-wbgo通过将wbgo基因克隆到pcdfduet-1中获得。
5.根据权利要求4所述的重组工程菌的构建方法,其特征在于,所述prsf-cbgw的构建方法为:
6.根据权利要求5所述的重组工程菌的构建方法,其特征在于,所述galu编码的氨基酸序列如seq id no.2所示;wbgo编码的氨基酸序列如seq id no.3所示;manc-manb编码的氨基酸序列如seq id no.4所示;gmd-wcag编码的氨基酸序列如seq id no.5所示。
7.根据权利要求3所述的重组工程菌的构建方法,其特征在于,所述菌株e06以大肠杆菌为出发菌株,敲除出发菌株基因组中的udp-葡萄糖脂质载体转移酶编码基因wcaj,β-半乳糖苷酶编码基因lacz,udp-乙酰氨基葡萄糖-2-异构酶编码基因wecb,糖外排蛋白编码基因seta,葡萄糖脱氢酶编码基因gcd;并将菌株基因组中nagb、poxb、arsb位点分别替换成编码β-1,3-n-乙酰葡糖胺转移酶的基因lgta;同时,将udp-葡萄糖-6-脱氢酶编码基因ugd位点替换为大肠杆菌mg1655基因组来源的编码尿苷二磷酸葡萄-4-差向异构酶的基因gale,并在基因组上过表达磷酸氨基葡萄糖变位酶编码基因glmm,获得重组菌株e06。
8.根据权利要求3所述的重组工程菌的构建方法,其特征在于,所述所述出发菌株为大肠杆菌bl21(de3);
9.一种如权利要求2所述的重组工程菌或如权利要求3-8任意一项所述构建方法得到的重组工程菌在制备lnfpⅰ中的应用。
10.一种生产乳糖-n-岩藻黄素五糖i的方法,其特征在于,以权利要求3-8任意一项所述构建方法得到的重组工程菌为发酵菌株,加入乳糖和iptg,发酵生产乳糖-n-岩藻黄素五糖i。